1. 「適者生存」とは最強者が生き残ることである
ダーウィンはハーバート・スペンサーから「適者生存」という言葉を借用しましたが、それを後悔しました。進化生物学における「適者」とは、最強や最も攻撃的という意味ではなく、現在の環境に最も適応していることを意味します。抗生物質耐性を持つ細菌は、抗生物質のある環境では耐性を持たない細菌よりも「適者」ですが、一般的な意味でより強いわけではありません。
2. 人間はサルから進化した
人間と現代の類人猿は共通の祖先を共有しており、親子ではなく従兄弟の関係です。人間とチンパンジーの最後の共通祖先は約600万〜700万年前に生息していました。一方が他方から進化したわけではなく、両者とも現在は存在しない共通の祖先集団から派生したものです。
3. 進化には複雑化という方向性がある
進化には方向性や目的はありません。自然選択は単に、現在の環境で繁殖を高める形質を保存するだけです。寄生生物は時間とともに単純化するように進化することがよくあります。細菌は、複雑な動物よりも（個体数、バイオマス、寿命の点で）圧倒的に成功しています。複雑化は一つの可能性であり、傾向ではありません。
4. 進化は「ただの理論」である
科学において「理論」とは「推測」を意味するのではなく、広範な証拠によって裏付けられた十分な説明を意味します。原子論、細菌説、重力理論はすべて「理論」です。進化論は化石記録、比較解剖学、遺伝学、実際の進化の直接観察（細菌、ウイルス、ガラパゴスフィンチ）、および分子系統学によって裏付けられています。
5. 進化論は生命の起源を説明する
進化論は、生命が存在した後の多様性や変化を説明するものであり、最初の自己複製分子がどのようにして生まれたかについては何も語っていません。生命の起源（非生物発生）は別の科学的問題です。ダーウィン自身もこの区別を明示的に述べていました。
6. 個々の生物が進化する
進化するのは個々の生物ではなく、個体群です。個体の寿命の中でDNAが変化することはありません（突然変異を除いて）。進化とは、世代を超えて集団全体で対立遺伝子の頻度が変化することです。この区別は重要です。キリンは首を伸ばすから首が長くなるわけではありません。首がわずかに長いキリンが数千世代にわたって生き残り、わずかに高い確率で繁殖するのです。
よくある質問
進化には方向性がありますか？
いいえ。進化には方向性、目的、あるいは複雑化への傾向はありません。自然選択は、現在の環境で繁殖の成功率を高める形質を保存します。寄生生物はより単純になる方向に進化するのが一般的です。細菌は、ほぼあらゆる尺度において、進化的に最も成功した生命体です。複雑さの増大は一部の系統における進化の可能性の一つに過ぎず、一般的な傾向ではありません。
人間はサルから進化したのですか？
いいえ、人間と現代の類人猿は共通の祖先を共有しています。彼らは進化上の従兄弟であり、親子ではありません。人間とチンパンジーの最後の共通祖先は約600万〜700万年前に生息していましたが、現在は絶滅しています。両系統はその共通祖先からそれぞれ別に進化したのです。
進化論が確認されているのになぜ科学者はそれを「理論」と呼ぶのですか？
科学において「理論」とは、推測や憶測ではなく、広範な証拠によって裏付けられた十分な説明を意味します。原子論、細菌説、重力理論はすべて「理論」です。進化論は、化石の証拠、遺伝学、比較解剖学、直接観察、分子系統学によって裏付けられ、科学界で最も徹底的に確認された理論の一つです。